《生物医学工程与临床》是生物医学工程及其相关临床医学的综合性学术刊物，公开发行以来，坚持“百家争鸣，百花齐放”的理念，同时也对学术道德失范做细致工作，提倡坚持真理可贵的学术品质，坚持学术原创性。
一、学术道德
依据中国科协《科技工作者科学道德规范》，对学术道德失范规定有如下行为：抄袭剽窃他人成果、伪造篡改实验数据、随意侵占他人科研成果、重复发表论文、学术论文质量降低和育人的不负责任、学术评审和项目申报中突出个人利益、过分追求名利和助长浮躁之风。中国知网的《科技期刊学术不端文献检测系统》对学术不端行为主要分为以下这四类：抄袭、伪造、篡改及其他。“其他”主要包括不当署名、一稿多投、一个学术成果多篇发表等不端行为。
本刊提倡学术道德的基本准则是：一、遵守中华人民共和国公民道德准则；二、遵守诚实原则，研究人员在数据资料采集分析、公布科研成果等方面必须实事求是，有责任保证所搜集和发表数据的有效性和准确性；三、遵守公开原则，在保守国家秘密和保护知识产权的前提下，公开科研过程和结果相关信息；四、遵守公正原则，研究人员应坦诚直率，科学公正，对竞争者和合作者作出的贡献给予恰当认同和评价，对研究成果中的错误和失误，应以适当的方式予以承认，不得以各种不道德和非法手段阻碍竞争对手的科研工作；五、尊重知识产权规定，研究成果发表时，做出创造性贡献且能对有关部分负责的人员享有署名权，未经上述人员书面同意，不得将其排除在作者名单之外。对参与一般数据搜集的研究助手、对研究团组进行过支持与帮助的人员和提供设施的单位，可在出版物中表示感谢；六、遵守声明与回避原则规定，在研究、调查、出版、向媒体发布、提供材料与设施、资助申请、聘用和提职等活动中可能发生利益冲突时，所有有关人员有义务声明与其有直接、间接和潜在利益关系的组织和个人，包括在这些利益冲突中可能对其他人利益造成的影响，必要时应当回避。
本刊从2010年开始，使用中国知网《科技期刊学术不端文献检测系统》，对学术不断文献严格审查，拒绝发表学术不端文章。
二、医学伦理
本刊刊登文章包括基础和临床，因此，伦理道德包括临床试验伦理和动物实验伦理。
临床试验文章的伦理体现的核心是“知情同意”原则，体现四个原则：行善原则、自主原则、避害原则、公正原则。涉及临床伦理文章，需要提供患者的知情同意书和伦理委员会的批准文件复印件。
对于动物实验文章体现：科学伦理统一原则；实验动物保护原则；实验动物福利原则；伦理审查监督原则。生物医学的每一次重大发展与进步，几乎都与动物实验息息相关，动物实验在整个生物、医学发展的历程中有举足轻重的作用。动物实验是生命科学研究的重要手段之一。在医学发展中，人们利用动物实验所获得的医学进步和突破也是不可否认的事实。对于动物实验，我们要科学地去分析、理解，既要看到动物实验研究是一件有利于人类自身发展的事情，又要看到动物保护有利于生态系统的平衡以及有利于人类进步和社会发展。在文章中要提供动物使用许可证号、动物许可证号等。
